ну для начала можно попробовать сменить язык окон вручную, типа клик по окну и альт+шифт . а уже после того как все заработает, то можно и автоматизировать смены языков. в справке есть пример, для смены языка кликера код будет примерно такой:
setkblayout($_hwnd_self, 1033) // англ.
halt
если версия кликера 4.12 и старше, то hwnd придется брать каким нибудь другим способом, $_hwnd_self только для версии 4.13
кстати, можешь еще попробовать ввод текста в режиме привязки, там раскладка не имеет значения. но это уже в крайнем случае, если у тебя в самом деле какаято защита или еще что ...