Раскладка должна совпадать и в кликере и в целевом окне.
Можно делать так
$hwnd1 = wndfind("Clickermann -") // получаем HWND окна кликера
$hwnd2 = wndfind("Заголовок окна") // получаем HWND целевого окна
SETKBLAYOUT($hwnd1, 1033) // устанавливаем английскую раскладку для окон
SETKBLAYOUT($hwnd2, 1033)