Аааааа, а-ааааааа!
А ничего что прокрутка мыши реализована в системе по особенному. Там учитывается над каким окном/элементом находится курсор и прокрутка в основном работает если курсор над нужным элементом. Так сделано для разных прокруток в разных элементах/фреймах.
Пенять на винду нужно, тогда уж. Если есть возможность можно заменить на нажатие стрелок или PgDown/PgUp, они работают в активном окне.
А если это запись, то там прокрутки нет по этой же причине. Есть повод уйти от записи и перейти уже к написанию скриптов.