В винде вообще что-то нахимичили в последнее время с языком.
По умолчанию в Windows 10 язык переключается сразу для всех окон в отличии от прошлых версий.
Да, пока развёрнуто проще переключать на окне кликера
SETKBLAYOUT($_hwnd_self, 1049)
Сейчас с их кривыми лапками при попытке переключить на стороннем окне, у меня сначала попереключалось, потом перестало переключать и раз через 5 начало просто крашить кликер. Вот закрывается молча и всё.
Можно попробовать включить как раньше, своя раскладка для каждого окна (Дополнительные параметры клавиатуры - Позволить выбирать метод ввода для каждого окна) и переключать по старинке для 2 окон приложения и кликера. Нужно пробовать.